呼吸系统常见疾病有急性上呼吸道感染，急性气管支气管炎，慢性支气管炎，慢性阻塞性肺疾病，支气管哮喘，支气管扩张，肺部感染性疾病，如肺炎。肺炎又包括细菌性肺炎，还有其他病原体所致肺部感染，比如说肺炎支原体肺炎，肺炎衣原体肺炎，病毒性肺炎，肺脓肿。此外，还有肺结核，肺癌，间质性肺疾病，间质性肺疾病，也有特发性肺纤维化，结节病。其他一些间质性肺疾病，过敏性肺炎，嗜酸粒性细胞性肺炎，肺血栓栓塞症，肺动脉高压与肺源性心脏病。还有胸腔积液，气胸，睡眠呼吸暂停低通气综合征，急性呼吸窘迫综合征，呼吸衰竭等。