蜡样芽孢杆菌活菌胶囊不能够长期吃，所有的药物都不能长期吃。蜡样芽孢杆菌活菌胶囊是益生菌，主要是治疗便秘、腹泻、胃肠功能紊乱、消化不良、症状缓解以后就需要停药。胃肠功能不好，在吃蜡样芽孢杆菌活菌胶囊的同时，可以吃点健脾的药，黄芪健脾口服液或者是参苓白术散。同时还要从平时的饮食上进行调理，平时不要吃的太多太杂，不要吃生冷、辛辣、油腻、刺激性的食物，以清淡饮食为主，还要多休息，多喝水，经常户外活动，锻炼身体，增强自身的免疫力。