痔疮导致肛门疼痛的原因很多：1、痔疮合并血栓，如果在长期的大便困难或者痔静脉迂曲肿胀，会导致血栓的形成。一般会伴随着肛门剧烈的疼痛，出现这种情况应当及时地行手术治疗，比如血栓剥离术。2、痔疮如果合并肛裂，比如大便干结容易导致肛管皮肤裂伤，在大便时容易导致肛门疼，出现这种情况，首先进行保守、药物治疗，可以肛周涂抹痔疮膏，肛内塞入痔疮栓进行抗炎、消肿的治疗。如果效果欠佳，疼痛比较重，也应当及时地行手术切除，比如痔切除术和肛裂切除术。所以痔疮屁眼疼的原因很多，应当结合病史还有查体，必要时行肛门镜检查来明确疼痛的原因，从而采取合适的治疗手段。