女性附件区的囊肿的治疗要根据其性质来治疗的。如果是生理性的囊肿或者是炎症引起的囊肿，是可以服用药物治疗的。如果是肿瘤，是需要手术的。如果是生理性的肿物，经过月经变化后不能消失，或者是服用避孕药之后不会消失，甚至有长大的趋势，是要手术探查的。如果是盆腔炎症引起的包裹性的炎症积液，可以使用中成药或者是中药清热解毒，活血化瘀的治疗方法，可以口服，也可以配合中药观察，定期复查。如果囊肿没有缩小，有增大的趋势，甚至会压迫周围的器官引起不孕病症的状况，是需要手术探查的。