肠胃紊乱多数患者可通过调整生活方式或改变作息习惯，达到肠胃的自身调节的效果。若通过改变基本的生活方式未得到好转，也可借助药物进行调节。常见的药物包括益生菌类药物，因肠道功能紊乱与肠道菌群改变有关。其次可服用胃肠黏膜修复药物，或使用可以调节该方面疾病的中药。若服用药物后未得到好转，需借助抗焦虑或抗抑郁的药物辅助调节。临床中胃肠功能紊乱发病率较高，心理治疗在胃肠功能紊乱的治疗中占据重要性的地位。