遵义南站和遵义站是两个不同的火车站，它们之间存在一些区别。

1．位置：遵义南站位于遵义市红花岗区长征大道南段，距离市中心较远；而遵义站位于遵义市汇川区大西门街道，距离市中心较近。

2．功能：遵义南站是高铁站，主要承担高速列车的停靠和发车任务；而遵义站是普通铁路站，主要承担普通列车的停靠和发车任务。

3．车次：由于功能不同，两个站点的车次也有所不同。遵义南站主要承担高速列车，如G、D、C等字头的高速列车；而遵义站主要承担普通列车，如K、Z、T、Y等字头的普通列车。

4．设施：由于遵义南站是高铁站，因此设施更加现代化、完善，包括候车室、自动售票机、自助取票机、餐饮等服务设施；而遵义站则相对简单，设施较为基础。

总之，遵义南站和遵义站在位置、功能、车次和设施等方面都有所不同，乘客在选择乘坐火车时需要根据自己的需求和实际情况选择合适的车站。