认定公证遗嘱有两份有效的方式：一般情况下，如果两份遗嘱没有冲突的，且均不违反法律规定，两份遗嘱都可以在被继承人死亡后生效的，如果内容相抵触的，以最后的遗嘱为准。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》第一千一百四十二条
遗嘱人可以撤回、变更自己所立的遗嘱。
立遗嘱后，遗嘱人实施与遗嘱内容相反的民事法律行为的，视为对遗嘱相关内容的撤回。
立有数份遗嘱，内容相抵触的，以最后的遗嘱为准。
第一千一百四十三条
无民事行为能力人或者限制民事行为能力人所立的遗嘱无效。
遗嘱必须表示遗嘱人的真实意思，受欺诈、胁迫所立的遗嘱无效。
伪造的遗嘱无效。
遗嘱被篡改的，篡改的内容无效。遗嘱没经过公证有效。遗嘱分为公证遗嘱、口头遗嘱、自书遗嘱、录音录像遗嘱，代书遗嘱，其中只有公证遗嘱需要公证，其他的遗嘱只要符合法律规定就有效。
法律依据：《民法典》第一千一百三十四条自书遗嘱由遗嘱人亲笔书写，签名，注明年、月、日。第一千一百三十五条代书遗嘱应当有两个以上见证人在场见证，由其中一人代书，并由遗嘱人、代书人和其他见证人签名，注明年、月、日。第一千一百三十七条以录音录像形式立的遗嘱，应当有两个以上见证人在场见证。遗嘱人和见证人应当在录音录像中记录其姓名或者肖像，以及年、月、日。第一千一百三十八条遗嘱人在危急情况下，可以立口头遗嘱。口头遗嘱应当有两个以上见证人在场见证。危急情况消除后，遗嘱人能够以书面或者录音录像形式立遗嘱的，所立的口头遗嘱无效。第一千一百三十九条公证遗嘱由遗嘱人经公证机构办理。