龟头有小水泡，首先考虑生殖器疱疹，是生殖器部位的单纯疱疹，是疱疹病毒引起的性传染性皮肤疾病。本病潜伏期2到7天，好发于包皮、龟头、冠状沟，伴有灼热、瘙痒、感觉异常，然后有斑疹、丘疹，水泡透明，破溃后有溃疡形成。要进行疱疹病毒的检测，然后进行抗病毒治疗，可以口服、外用，还建议服用抗病毒口服液、注射干扰素，提高免疫力，促进病毒愈合。龟头有小水泡，还有可能是包皮龟头炎引起的，发病初期可有水泡，可有充血水肿，之后可以破溃糜烂。