有患者问阴茎根部里面隐隐作痛是怎么回事？如果是阴茎根部隐隐作痛，首先考虑有没有尿道结石或者膀胱结石。如果有尿道结石或者是膀胱结石，会有明显的不适感或者是疼痛，疼痛可能会向龟头放射或者是睾丸放射。其次，如果膀胱有炎症，也会有阴茎根部不舒服的情况。再有，阴茎根部和前列腺的位置比较靠近，如果前列腺有炎症，也会出现阴茎根部不适感。还有，阴茎是否本身尿道有炎症，比如说小便有刺痛，有分泌物，可能考虑尿路感染，这种情况还是比较多见的。具体情况还是要患者及时就医以后，由医生检查完善B超、尿常规、尿道分泌物培养等检查，才能明确到底是什么病因。