屁眼里面如果有疼痛的发生，首先考虑有肛门周围脓肿的存在或者有直肠粘膜下的脓肿，由于肛窦在受到细菌感染以后，身体抵抗力下降或者由于作息时间不规律以及治疗不及时等外来因素的影响，感染进一步蔓延，导致肛门周围组织发生坏死液化，进而有脓液的形成，会出现屁眼里面的疼痛。还可能是由于增生性的疾病，比如肠道内的肿瘤，破坏了周围组织内的神经，也可以产生疼痛的症状。