根据不同性质的囊肿，所选择的治疗方式是不同的。1、生理性的卵巢囊肿。在排卵期的女性做B超检查，如果发现卵巢囊肿，囊肿小于5公分时，多数考虑为黄体囊肿，属于生理性的卵巢囊肿，一般不需要治疗；如果囊肿比较大，可以考虑口服短效避孕药，3-6个月后再进行复查。2、感染性的卵巢囊肿。如果女性的输卵管卵巢出现炎症，可能会导致输卵管卵巢囊肿。这是炎症性的囊肿，可以在医生的指导下应用抗生素消炎治疗。同时给予一些中成药来软结散坚，如桂枝茯苓丸、红金消结胶囊等，但是建议要在医生的指导下治疗，并随访。3、肿瘤性的卵巢囊肿。这种囊肿绝大多数是良性的，但也有个别有恶性的可能性。如果出现肿瘤性的卵巢囊肿，还是要采取积极的手术治疗，将囊肿切除，并将囊肿送病理化验，根据病理的结果，决定下一步的治疗。