脚气感染的灰指甲要在医生指导下，局部涂抹抗真菌药物来进行治疗，脚气感染灰指甲一般是真菌感染，甲板以及甲下组织等造成会导致。治疗前患者要对局部使用抗真菌消毒水清洗治疗，也要将指甲部位变薄或者是剪掉，有利于与皮肤吸收抗真菌药物，可以提高药物治疗效果。长时间治疗病情反复发作没有得到改善，也要配合口服抗真菌药物来调理。