肾积水严重时会引起尿毒症。双侧的尿路梗阻肾积水或者是孤立肾患者出现单侧的尿路梗阻，可发生肾后性的急性肾损伤。尿路发生梗阻时，尿路内反向压力首先传导到肾小球囊腔，由于肾小球入球小动脉扩张，早期肾小球滤过率暂时维持在正常范围。如果梗阻持续无法解除，肾皮质大量区域出现无灌注或者是低灌注的状态，肾小球滤过率将逐渐降低，最终出现尿毒症。肾积水的早期通过解除梗阻之后，肾功能可完全或者是部分恢复。肾积水如果长时间没有得到治疗，则会出现肾功能的逐渐丧失，最终发展为慢性的肾功能衰竭。