子宫内膜异位症可以通过病人的症状、妇科检查、B超检查、化验血中的CA125是否升高来诊断。但确诊有赖于腹腔镜下的组织活检的病理结果。如果病人有进行性的痛经、不孕，在做B超时看到卵巢有混合性包块。妇检时能摸到后穹窿有触痛结节，双附件区有压痛。另外，血CA125明显升高。通过这些检查可以提示有子宫内膜异位症。但主要的诊断标准还是以腹腔镜下见到盆腔异位结节病灶，再结合手术后的病理结果确诊。