肝内胆管结石的治疗方法选择如下：1、如果是向上能够剖开肝内胆管，能把石头取尽，可以做一个胆道的肝内胆管的置管或者是做一些胆肠吻合，这都是一些必要的术式。2、如果有肝段的或者是肝叶的肝萎缩了，同时合并肝段或肝叶的切除。3、如果是胆管结石对肝段对肝叶影响比较大，而且肝脏还没有肝萎缩的情况下，有时就没有必要去切肝，可以单纯做胆总管切开，摆一个T管，石头能解决尽量解决，如果石头在术中解决不了，可以术后靠胆道镜再去处理。