施工合同未办理备案不合法，这是由于在《建设工程质量管理条例》等法律规范之中，明确规定了建设单位需要带着施工合同等的材料，到建设行政主管部门或者其他有关部门备案。若是有备案义务却不按照规定办理备案手续，无疑就是违法了。