肾结石碎石以后还疼，可能的原因如下：1.体外冲击波碎石无效。见于结石质地比较硬、密度比较高，冲击破碎时不能将结石完全粉碎，仍然造成结石残留在体内，所以疼痛并不会减轻。2.合并感染。即便经过体外冲击波碎石以后，局部黏膜水肿，仍然没有排石，所以此时疼痛并不会减轻。需要进行抗感染、消肿等综合处理。3.多发肾脏结石。即便经过体外冲击波碎石以后，排石过程中仍然会有疼痛。因为肾脏结石排入输尿管，再排入膀胱大约需要3~7天的时间。在这个时间段内仍然会有间断的疼痛感，属于术后排石的一种正常现象。建议严格到医院进行B超随访，观察排石的情况。