根治肺炎支原体感染，需要选择敏感的抗生素。肺炎支原体是一种特殊的病原体，容易导致呼吸道的感染，此病不能够选用头孢或者青霉素类的抗生素，而是需要选择左氧氟沙星、莫西沙星等昆诺酮类抗生素，或者使用阿奇霉素等大环内酯类抗生素。通过上述抗生素的治疗，肺炎支原体感染是可以断根，但是一般来讲，抗生素的疗程要用足，可能需要长达两周左右的时间。另外肺炎支原体感染这种疾病相对于其他病菌的感染是容易出现复发，尤其是在儿童当中，可以多次复发，导致反复的肺炎支原体感染，甚至引起肺炎支原体肺炎。