怀孕三个多月肚子疼，引起疼痛的原因比较多，如果是轻微隐痛，可能与怀孕后子宫增大韧带牵拉有关，属于正常现象。如果是一阵阵肚子疼，伴有少量阴道出血症状，也有的并不一定有阴道出血现象，应该是先兆流产的原因，先兆流产主要是注意休息、保胎，也可以服用黄体酮或地屈孕酮保胎治疗，如果疼痛比较严重，需要及时住院保胎治疗。如果疼痛部位位于右下腹，并有压痛、反跳痛，可能是患有阑尾炎。如果疼痛为持续性绞痛，应及时去医院，并做B超检查，看有没有卵巢囊肿蒂扭转或破裂的可能。如果疼痛位于肚脐周围，有恶心、排便感，可能是吃了不洁食物，应该是胃肠道问题导致的疼痛。