导致女性肚脐眼疼痛的原因，主要包括以下几方面：1、考虑是由于机体胃肠道消化吸收功能紊乱引起。多由于平时饮食不注意，经常进食辛辣、刺激、寒凉食物或暴饮暴食的等，导致机体胃肠道蠕动功能紊乱，引起肚脐周围疼痛。这种原因引起的疼痛，和饮食有密切关系，治疗主要是调整饮食习惯，局部可以配合用来暖水袋热敷等。2、考虑是由于机体妇科疾病，包括慢性妇科炎症等刺激引起。妇科炎症引起的肚脐周围疼痛，多会伴有妇科疾病，需要到医院就诊，做妇科常规和妇科B超检查以明确。如果肚脐眼疼痛剧烈，需要及时到医院就诊，如果疼痛程度较轻，可以通过热敷、理疗等观察。