龟头上长水泡的原因如下：一、龟头炎。龟头局部还会出现疼痛、肿胀、红斑、渗出等症状，如果持续加重，还可形成脓包，破裂后会出现脓性分泌物，主要为细菌或真菌等病原体感染所引起。确定致病菌的类型后，使用相应抗生素类药物进行治疗；二、疱疹病毒感染。通常会使龟头部位出现簇状分布的小水泡，水泡在破裂后有明显的疼痛感，局部还会出现糜烂，可通过性生活传播。需要进行疱疹病毒的相关检测，确诊后，应进行抗病毒治疗。