男性小便时候尿道刺痛，通常患者是因为尿路感染导致的，需要进行正规抗菌药物治疗，一般选择头孢或磷霉素进行治疗，如果患者是因为支原体、衣原体导致的，则需要服用四环素类药物进行治疗，男性小便疼痛，出现刺痛感觉，此时一般要给患者首先进行尿常规的检查，以明确患者是否有尿路感染，如果患者出现尿路感染，说明刺痛是尿路感染引起来的，这时患者的尿液中白细胞会明显增高，需要给患者服用头孢和磷霉素等一些抗菌药物进行治疗，如果患者此时尿常规其实比较正常，或者尿常规治疗之后恢复正常，但仍有小便刺痛的症状，说明患者可能有支原体衣原体等非链球菌道炎导致的不适症状，这些患者可以服用多西环素等四环素类药物进行治疗，一般治疗7到10天之后，嘱患者复查，如果支原体、衣原体都转阴，说明疾病治愈，此事方可停药。