宝宝消化不良，建议遵医嘱服用以下药物：1.可以按照医生的指导，适当服用具有调理脾胃功能的药物，其中包括醒脾养儿颗粒、小儿健脾散，或者参苓白术散等。因为宝宝消化不良与脾胃运化、排空功能减弱有关，遵医嘱适当服用上述药物，可以有效改善胃肠道消化功能，促进消化不良症状恢复。2.可以按照医生的指导，适当给宝宝服用具有调理肠道内环境平衡的药物，其中包括枯草杆菌二联活菌颗粒、酪酸梭菌活菌散，以及双歧杆菌三联活菌散等。这些药物能够帮助宝宝调理肠道内菌群的平衡，促进食物的消化吸收，改善宝宝消化不良症状。