腰部一侧疼痛的原因如下：一、植物神经功能紊乱。本病发病时疼痛，晨起症状加重，腰部活动以后疼痛的症状会减轻。二、妇科疾病。当出现妇科疾病的时候会出现腰部疼痛，比如子宫和附件炎症等，发病后通过妇科彩超和妇科专科的检查诊断。三、腰椎疾病，比如腰椎管狭窄的时候，出现一侧腰部疼痛，并向患侧下肢放射，腰椎核磁共振或CT检查明确诊断。