引起女性小肚子疼痛的原因有很多，消化系统疾病、泌尿系统疾病、妇科疾病均可以导致女性腹部疼痛。消化系统疾病，如急性胃肠炎、胃炎、胆囊炎、阑尾炎、肠梗阻均可以引起腹部疼痛。泌尿系统疾病如尿道炎、膀胱炎、急性肾盂肾炎、肾结石等，也可以引起小腹部疼痛。女性的妇科疾病如附件炎、盆腔炎、卵巢囊肿蒂扭转、宫外孕、黄体破裂、痛经、子宫内膜异位症等也可以引起小腹部疼痛。