石榴石和玛瑙的主要区别在于颜色、功效和净度不同，石榴石的颜色主要以红色为主，表面的光泽呈玻璃光泽，断口处为油脂光泽。而玛瑙的颜色有红色、绿色、黄色、灰色等，表面呈玻璃或者油脂光泽。

石榴石的颜色和石榴籽比较类似，故因此得名，它的颜色主要以红色为主，有的是紫红色、粉红色等，而玛瑙的颜色丰富多样化，常见的有红色、绿色、黄色、灰色等。

石榴石对人体具有很高的养生功效，可以促进人体的血液循环，增强人体的生命力和免疫力，起到美容养颜的功效，而玛瑙可以消除人体的负能量，使其快速恢复体力，比较适合体弱的人群佩戴。

石榴石和玛瑙的净度也是大不相同，石榴石主要以半透明或者微透明居多，表面呈玻璃光泽，断口处为油脂光泽，而玛瑙是以透明居多，表面为油脂或者玻璃光泽。