临床上能够引起咳嗽咳褐色痰的原因有很多，主要考虑可能是呼吸系统相关疾病引起的症状，可能的呼吸系统相关疾病包括:咽炎，气管炎，肺炎，支气管扩张，肺结核，肺气肿，肺脓肿和肺肿瘤等。想要明确病因，需要进行相关检查，包括:双肺CT检查，结核菌素试验，电子喉镜检查，痰细菌培养和药敏试验，肺肿瘤标志物检查等，根据检查的结果才可以明确病因。