小便会刺痛常见的疾病以及治疗的药物如下：一，尿路感染，尿路感染患者由于炎性物质刺激膀胱或者尿道黏膜，会出现解小便的时候尿道有刺痛感。一般治疗上会使用抗生素控制感染，常用的抗生素有头孢类或者喹诺酮类，可以根据经验选择合适的抗生素进行治疗，也可以取患者的尿液做培养，根据培养的结果选择敏感性的抗生素进行治疗。如果患者尿频，尿急，尿痛症状比较明显，还可以服用碳酸氢钠片碱化尿液，这样能够减轻患者的症状。二，尿道结石，当结石卡在尿道中时，如果结石体积比较小，一般不通过药物治疗，主要是通过多喝水，多跳，让结石自行排出。如果结石体积比较大，需要通过手术治疗。