甲状腺囊肿的治疗要根据囊肿的具体情况来定，大部分甲状腺囊肿是不需要药物治疗的；只有当囊肿出现压迫症状，比如压迫气管、食管引起呼吸困难、气促、咳嗽或吞咽困难时，这个时候可能就要进行手术治疗切除。第二、如果是甲状腺囊肿合并功能的改变，比如引起甲状腺功能亢进症，这时候可以根据情况选用抗甲状腺药物治疗和手术治疗。如果引起甲状腺功能减退症，可以选择予甲状腺素来补充治疗，所以具体的治疗要根据囊肿的具体情况而定。