百令胶囊在对肺肾疾病进行治疗时，具体用药多长时间可以停药，这种情况因人而异，要根据疾病的具体情况来决定，因为该药属于中成药，主要成分是冬虫夏草，所以一般的用药时间可能会比较长，主要是调理作用，具体停药的时间和节点要根据疾病目前情况来决定。所以一定要在专业大夫的指导下，根据个人目前的疾病来正确地选择药品治疗，以及在治疗过程中定期对肺肾功能以及发病进行排查，明确疾病的愈合程度来及时对药物进行停止。