治疗鼻窦炎可以应用青霉素类、头孢类、大环内酯类消炎药。急性鼻窦炎的致病菌多为肺炎双球菌、溶血性链球菌、葡萄球菌，其次为流感杆菌、变形杆菌或厌氧菌。可选用广谱抗生素，如青霉素类、头孢类抗炎药，有过敏病史的可选用大环内酯类消炎药。除了服用消炎药，也可联合应用收缩鼻粘膜类鼻喷剂、鼻腔冲洗、促进黏液排出剂、具有通窍作用的中成药治疗。慢性鼻窦炎保守治疗效差及真菌性鼻窦炎者应考虑手术治疗。