长时间服用头孢菌素：首先会导致药物发生耐药，因为头孢菌素使用往往是有明确的感染指征才可以使用，如果使用时间过长，各种细菌有可能会对头孢菌素产生耐药，使得再发新的感染时使用某种头孢菌素，效果比较差。第二种危害是长期使用头孢菌素，导致患者出现肠道菌群失调以及出现继发二重感染。因为头孢菌素，它毕竟是一种杀菌药物，如果长时间饮用，就会导致肠道内某些细菌被杀灭过多，而相应的其他细菌就会过度繁殖，从而引起菌群失调，出现腹泻、腹胀等其他表现，严重者会继发真菌的感染。第三肿危害主要是头孢菌素本身就有一定的药物副作用，造成胃肠道不刺激，肝肾功能影响，长时间服用，如果不及时的监测，这些损害也是持续性导致。