针对于儿童细菌性肠炎发烧的情况，可以采用下面的措施处理：首先，给儿童及时的退热治疗。在体温达到了腋下38.5℃的时候，儿童会出现头痛以及周身的酸软不适，可以给儿童及时的应用布洛芬进行退热处理。其次，给儿童进行抗菌药物的应用。儿童之所以出现细菌性肠炎，是由于细菌性感染引起的，细菌性感染被控制以后，儿童的肠炎发热自然就会消失，可以应用头孢克肟、头孢曲松等头孢菌素治疗。最后，需要给儿童及时进行止痛处理。儿童细菌性肠炎发生以后会有腹痛，可以给儿童应用顺时针按摩腹部的方法止痛。