日本粮食自给率低的原因有以下几个：

1．土地资源有限：日本国土狭小，且大部分地区山地和丘陵地形，适宜农业的耕地非常有限。

2．人口老龄化：随着日本社会的老龄化，农业劳动力的供给不足，导致耕地的利用率降低。

3．气候条件不利：日本地处亚热带和温带交界，气候多变，自然灾害频发，如台风、地震、洪水等，对农业生产造成了很大的影响。

4．粮食价格高昂：由于日本的粮食市场保护政策，粮食价格高昂，使得本国生产的粮食难以与进口粮食竞争。

5．农业生产方式落后：日本的农业生产方式相对落后，缺乏现代化的农业技术和设备，导致生产效率低下。

综上所述，日本粮食自给率低的原因是多方面的，需要政府和农业部门采取有效的措施来提高农业生产效率和粮食自给率。