贲门癌早期常无症状，部分患者可以出现腹胀不适，消化不良，进食哽咽，上腹痛等。症状首次出现后可不连续出现，隔数日或数月后再度出现，也可有上腹部烧灼、刺痛感。随着疾病的进展进入中期，患者会出现进食梗阻，进食后呕吐，体重减轻，上腹痛以及低热，可伴有贫血，厌食，乏力，上腹部触及肿块，有压痛。上腹疼痛常与进食相关，主要位于上腹部、左上腹。如果进入晚期，可以出现进食困难，严重者仅可进食流质饮食，上腹痛加剧，呕血，黑便恶病质等。晚期转移到肝脏可出现右上腹痛，发热；出现腹膜播散者，可见大量腹水，甚至伴有梗阻症状；如果转移至肺部，可引起咳嗽，呃逆，咯血，累积胸膜可产生胸腔积液并发呼吸困难；侵袭胰腺时可出现背部放射痛。