霉菌性的龟头炎是属于真菌感染的一种。所以在治疗方面主要是选择具有抗真菌作用的药物。由于龟头炎主要局限于皮肤表面，所以并非特别严重的情况下，不需要口服药物，可以使用抗真菌的药膏来涂抹龟头治疗就可以。比较常用的有达克宁乳膏，盐酸特比萘芬乳膏。另外还可以注意补充维生素B都有助于改善真菌，如果是较为严重，需要配合口服药物，比如说氟康唑，克霉唑片等等。不过口服药物不能长期吃，否则有可能会影响到个人的肝功能，如果只是偶尔吃几天一般影响也不大。