益生菌一般建议饭后20分钟服用，最好由于饭后胃酸浓度降低，更有利于益生菌达到肠道发挥作用。此外，冲服益生菌时避免使用开水，由于高温会杀死里面的有益菌，建议用30到40度的温开水冲调刚好。此外，益生菌不能与抗生素同时服用，以免影响益生菌的疗效，建议益生菌与抗生素服用时需要间隔3到4小时。临床上常见的益生菌有双歧杆菌三联活菌，枯草杆菌肠球菌二联活菌，地衣芽孢杆菌，复方嗜酸乳杆菌等。