男性龟头上有小疙瘩的原因有很多。比较常见的第一种就是阴茎的珍珠状丘疹，主要是由于包皮过长、包茎或者局部卫生不良的患者，由于长期的慢性刺激，最终而形成一些肉芽样的突起，当然这种疾病并没有什么感觉，没有出血及无分泌物，可以长期的存在，在体积大小和数目等不发生明显的变化，这种情况并没有传染性，所以不需要特殊的处理。再有就是一些性传播疾病，最常见的就是尖锐湿疣这种疾病，由于不洁的性交接触或者是人感染了病毒，就可以在生殖器部位出现不光滑的物质，如果是尖锐湿疣就需要激光或手术治疗。