连花清瘟颗粒的副作用主要表现为胃肠道的刺激，尤其是针对脾胃虚弱和有胃肠道基础疾病的患者，如慢性胃炎，胃溃疡等疾病，这类患者由于服用这些药物，有可能会造成腹部的疼痛，恶心，呕吐等不适。而连花清瘟在各种病毒性感冒早期，有明确的抗病毒效果，如果其造成胃肠道刺激，往往与患者本身的胃肠，脾胃虚弱有关。在口服过程中，可以适当的调整时间，如在餐后1到2小时后服用，减少胃肠道刺激，也可以采用口服叶酸等药物，以后再服用。如果采用这种预防措施，以后仍然出现明显的胃肠道刺激，建议及早的停药，更换其他的抗病毒和感冒药物。