期货豆一和豆二区别在于豆二合约涵盖了美国、南美产大豆，是世界上最具有包容性的大豆期货合约，豆一只涵盖国内。豆一合约只允许非转基因大豆参与交割；豆二号期货合约允许转基因大豆和非转基因大豆参与交割。豆二期货合约允许转基因大豆和非转基因大豆参与交割。在合约定价上，豆一合约价格将包装物计算在内，因此豆二合约采用散装和袋装并行的方式，兼顾进口与国产大豆流通的不同包装方式，而豆一合约则只采用袋装的包装方式，与国产大豆现货流通的袋装方式相吻合。