阴茎捏着有硬疙瘩原因是比较多的，常见的有尿道结石、尿道肿瘤、包皮垢、龟头的肿瘤、阴茎硬结症、尖锐湿疣等等。需要进行体格检查、血常规、尿常规、彩超以及分泌物的涂片检查和膀胱镜、尿道镜等等，来明确诊断。只有诊断明确了，才能够进行针对性的处理，比如尿道结石的患者可以进行手术处理，阴茎硬结症的患者可以进行理疗、药物、手术等综合性的处理，而包皮垢的患者，需要上翻包皮，清除包皮垢，进行包皮环切手术等等，如果存在局部的肿瘤，则需要进行手术切除。