盐酸左氧氟沙星眼用凝胶的副作用，对于60岁以上的老年患者接受糖皮质激素治疗者和接受肾移植，心脏移植或肝移植的患者，本品可导致肌腱炎和肌腱断裂的风险增加，需要慎用。本品可使重症肌无力患者的肌无力症状恶化，肾功能不全不能用，有中枢神经系统疾病即有癫痫病史者，也应该慎用。对喹诺酮类药物过敏者，妊娠及哺乳期妇女，18岁以下患者，要慎用甚至禁用。左氧氟沙星眼用凝胶对细菌性结膜炎，细菌性角膜炎具有独特的疗效，需要权衡利弊使用。