巨细胞病毒感染后的症状可以累及多个系统，大多数患者可以表现为发热的症状，儿童感染后的发热程度较高，可以出现为高热。巨细胞病毒感染可以导致肝脏发生损害，患者可以出现食欲下降、皮肤黄疸等症状，同时可以伴有肝脾的肿大。有些患者可以出现肠道的炎症，表现为腹痛、腹泻的症状，部分患者还可以发生病毒性的间质性肺炎，患者可以出现咳嗽、呼吸困难等症状。有些患者可以导致神经系统的损伤可以出现癫痫的症状，儿童发病后还可以影响智力发育。但是临床上大多数患者为隐性感染无明显临床表现。