婴儿肠炎的时候主要根据引起肠炎的病因用药，同时针对肠炎的症状给予用药，具体如下。第一，病因用药，引起肠炎的病因大多是消化不良、病毒或者细菌感染，单独以消化不良为主时，只需对症给予治疗就可以，如是病毒引起，可给予抗病毒口服液进行治疗，如果是细菌感染引起的肠炎，可以口服头孢克肟或者阿莫西林颗粒等抗生素进行治疗。第二，针对症状治疗，如给予止泻，有发热，就给退热治疗，止泻治疗常用的口服药物有醒脾养儿颗粒或者蒙脱石散等药物，同时配合益生菌治疗。