治疗肛瘘还可以将药物注射至创腔或脓腔，将创腔或瘘道中的脓液冲洗干净，并使其引流通畅。可将抗生素等药物注入创腔，起到控制感染，促进肉芽组织生长以及闭合管腔的作用，适用于肛瘘局部肿胀疼痛，外口分泌物多的患者。一般可以应用生理盐水、抗生素溶液进行注射治疗，注意应用过氧化氢冲洗时避免冲入直肠壶腹内，以免产生黏膜刺激症状。如果想彻底的根除肛瘘，应当积极的行手术治疗。以上方案仅供参考，具体药品使用请结合自身情况在专业医生指导下用药。