尖锐湿疣的治疗可以通过外用药物，目前临床上最主要的两种药物是鬼臼毒素酊和咪喹莫特霜。鬼臼毒素可以直接让疣体坏死、萎缩，从而消除疣体，而咪喹莫特可以通过激发身体的免疫功能，达到治疗尖锐湿疣的效果。一般来说，如果较大的疣体，建议选择鬼臼毒素，而疣体较小的宜选择咪喹莫特。除了药物治疗以外，尖锐湿疣还需要结合其它的治疗方法，可以用激光将疣体去除，也可以用冷冻将疣体去除。