非特异性直肠肠炎的主要治疗方法，是通过药物进行治疗。出现这种情况，一般是考虑有溃疡性的结直肠炎，或者是克罗恩病的情况。首先，就是使用5-氨基水杨酸制剂进行对症的治疗；其次，在急性期的时候，可以适当的使用糖皮激素药物进行治疗，效果不理想还可以考虑使用生物制剂或者免疫抑制，进行对症治疗；再者，还可以采用中医药的治疗方法，包括中药的保留灌肠，以及中药的口服。非特异性的结肠炎，在进行药物对症治疗的同时，也一定要保持生活作息时间的规律，尤其是注意调整饮食结构，避免过于粗糙的食物，避免过于干硬的食物，在进食的过程当中，也一定要注意做到细嚼慢咽。