手足口病是会引起头痛的，手足口病是由一组肠道病毒感染引起的急性传染病，会引起病毒血症，在急性病毒血症时期可以出现头痛的症状，但通常持续时间比较短暂，体温降至正常后，头痛自行缓解。此外，部分患儿感染手足口病后，可引起重症手足口病，可以引起脑炎，脑膜炎等症状。此时，年长患儿可以表现为头痛症状，甚至可出现呕吐，嗜睡，抽搐，昏睡，昏迷等症状。需要及时到医院住院治疗，以降低病死率。