小儿慢性肠炎，需要首先检查明确病因，确诊病因以后才能确定吃什么药物。在小儿使用药物时一定要特别谨慎，最好是在儿科医生的指导下来选择一些中成类的药物，另外就是一些促消化的药物和肠道益生菌类药物等相对比较安全一些。一般来说，对于小儿慢性肠炎，往往是因为饮食不当，气候变化等引起的，在这种情况下可以使用健脾药物，健胃的药物以及双歧杆菌等来进行调理，如果小儿慢性肠炎和感染因素有关的话，还应该使用敏感抗生素进行积极的抗炎治疗。