儿童长期吃药，容易导致以下不良后果：1.导致胃肠功能紊乱。孩子长时间用药会使胃肠道菌群受到刺激，造成菌群失调，可能会导致孩子出现腹泻、食欲降低等症状。比如孩子长时间用抗生素，可能还会诱发真菌性肠炎。2.造成免疫力降低。一般长期用药，由于药物有许多副作用，容易使孩子的免疫力降低，后期还可能使孩子有药物依赖性。3.导致肝肾功能损伤。长期用药需要经过肝肾功能代谢，会加重肝肾功能负担，易致肝肾功能损伤。4.产生耐药性。比如长期应用抗生素，容易产生耐药性。